Jód má dôležitú funkciu pri tvorbe sekrétu štítnej žľazy. Aktivita štítnej žľazy je závislá na celkovom množstve jódu v žľaze. Normálna štítna žľaza obsahuje 2 mg jódu na 1 g sušiny.
Štítna žľaza patrí medzi orgány s vnútornou sekréciou. Produkuje hormóny tyroxín (T4) a trijódtyronín (T3), ktoré regulujú metabolizmus a kalcitonín, ktorý udržiava hladinu vápnika v krvi. Pre tvorbu hormónov je nevyhnutný jód. Tu sa môžu vyskytovať poruchy, konkrétne znížená (hypotyreóza) alebo zvýšená činnosť štítnej žľazy (hypertyreóza).